用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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水平位置:;垂直位置:

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颜色7-9:
颜色10-12:
颜色13-15:
颜色16-18:
颜色19-21:

up,down颜色或者大于阈值,小于阈值颜色
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scRNA-seq 火山图

简介
scRNA-seq火山图是多个cluster(vs 其他cluster)的并排火山图。X轴是细胞类型;Y轴是log2FC,越大越向上下两侧。注:这里没有体现p值。调用scRNAtoolVis R包。注:这个图有个bug,标注的基因名指向的点会不存在。非bug版(但样式少)请使用单细胞火山图模块
数据说明
输入数据为7列:p_val avg_log2FC pct.1 pct.2 p_val_adj cluster gene
论文例子
A Spatiotemporal Organ-Wide Gene Expression and Cell Atlas of the Developing Human Heart
输入 示例数据
输出

如何引用?

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正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.