用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

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必需输入  圆形相关系数视频教程   文字教程
绘图数据(行为基因,列为样品)


可选输入
数据转换


相关系数方法


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colorbar位置
水平位置:
垂直位置:

连线(相关性)颜色
低:
中:
高:

基因(外圈的带)颜色(可选10种,最多绘制30种)
颜色1-2:
颜色3-4:
颜色5-6:
颜色7-8:
颜色9-10:

其他
基因名与基因带的距离:
基因带宽度:

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圆形相关系数

简介
根据基因的表达值计算基因两两间的相关系数,将相关系数矩阵结果用圆形展示,其中红色表示正相关,绿色表示负相关,本质上是一个弦图。调用circlize R包。
输入数据说明
输入数据为矩阵形式,行为基因,列为样品(请自行转置)。
论文例子
CUL4B promotes prostate cancer progression by forming positive feedback loop with SOX4. Fig 3F
论文写作
Circos graph displaying the co-expression networks of Sat1 with 10 genes in cancer samples. Each sector of the circle represents one gene, and its width indicates the total amount of co-occurrence that connects one certain gene to the other. The width of each link represents the total co-expression times of the linked genes.
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
3000+篇google学术,2400+篇知网学术引用
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2024), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 20 Feb 2024) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号