用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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节点大小
节点大小由两部分构成:base大小+degree*scale
其中base表示节点基础大小,degree表示连线数,scale表示放大倍数
若scale为0,则节点大小完全一样,都是base
若base为0,节点大小由degree数*scale决定
base大小:;scale因子:

其他
节点标注文字大小:
连线权重(值越大,线越粗):
连线弯曲程度(0时为直线):
相关系数阈值(低于该绝对值的不参与绘图):

节点形状


布局


相关系数方法


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相关系数网络图

简介
根据基因间的两两相关系数值,调用igraph R包绘制网络图,相关系数越大,连线越粗。与传统的矩阵形式图相比,图更加简洁、丝滑。
数据说明
数据为矩阵形式,行为基因,列为样品。计算pearson或者spearman相关系数。
论文例子
Ferroptosis-Related Genes in Lung Adenocarcinoma: Prognostic Signature and Immune, Drug Resistance, Mutation Analysis Fig1E
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如何引用?

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正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 June 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.