用前必读
1,使用输入检查工具检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或者AI,inkscape修改文字、字体,图例位置,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

人工客服  基因名转换  FC,P转换  常用配色  影响因子 新需求及bug提交  pdf转图片

必需输入  GO弦图视频教程   文字教程
绘图数据(1,首列不重复;2,若有logFC列,则该列名字必需是logFC,大小写敏感)
(3,请删除数据全是0的行或者列;4,建议5-10条)
数据必需是0或者1,不能有其他数值


可选输入
图片大小
图片宽度:
图片高度:

文字大小
基因文字大小:
GO图例文字大小:
logFC刻度字体大小:
注意:字体太大时,文字会被截断,请使用AI编辑结果图片已显示所有元素

排序


logFC颜色(若无logFC列则默认灰色,请用AI编辑以移除logFC颜色条)
低颜色:
中颜色:
高颜色:

term弦颜色(自定义10种,10+种用系统默认颜色)
颜色1:
颜色2:
颜色3:
颜色4:
颜色5:
颜色6:
颜色7:
颜色8:
颜色9:
颜色10:

字体


GO chord图(GO弦图)

简介
使用弦图展示富集结果,左边是基因,右边是GO term,中间的连线表示从属关系。可以使用GO analysis或者metascape提交基因,计算富集,得到结果后进行绘图。参考格式转换页面。调用GOplot R包
输入数据说明
数据包括3部分,第一列是基因,最后一列是logFC(名字不变,仅替换数据即可),即基因的变化倍数,用于排序及基因块颜色(若没有logFC,程序会自动添加,基因色块用灰色)
其余列是GO term,其中1表示该基因在这个GO term中,0表示不在(必需是0或者1,不能是其他数值)。默认不过滤,即有几个显示几个,20-30个基因,6-8个term效果比较好。最多绘制30个。
注意:
1. 也可以用于具有类似包含关系的其他数据中,例如KEGG Pathway。
2. 若term名太长,可以用inkscape编辑svg输出图片。
3. 若不是正圆,修改图片长度或者高度参数。
4. 若logfc没显示,可以用编辑器编辑图片以显示。
论文例子
An intersectional analysis of LncRNAs and mRNAs reveals the potential therapeutic targets of Bi Zhong Xiao Decoction in collagen-induced arthritis rats
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
2600+篇google学术,2100+篇知网学术引用
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Nov 2023), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 10 Nov 2023) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号