用前必读
1,输入数据格式(标题、行、列)必需与示例一致,请仔细看右侧说明和示例,标能缺,不能有中文,特殊符号等
2,推荐使用excel调整数据(wps不行),然后拷贝粘贴到输入框
3,修改文字字体,图例位置,处理文字截断等图片编辑,请参考inkscape实操
4,更多干货,请右下扫码,关注”微生信“公众号或加群讨论!
注意:1,不要用微信打开,用浏览器,推荐edge或chrome!
2,没有预览就是作图失败,请检查输入数据格式!
3,智能客服  人工客服  基因名转换  在线svg编辑器  FC,P转换  常用配色  影响因子查询

必需输入
绘图数据(若提供logFC列,则logFC列的header必需是logFC,大小写敏感)


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基因文字大小:
GO图例文字大小:
注意:若logfc没显示,缩小GO图例文字大小

排序


带的边线大小(0则不绘制边线):

logFC颜色(若无logFC列则默认灰色)
低颜色:
中颜色:
高颜色:

term弦颜色(最多10个term)
颜色1:
颜色2:
颜色3:
颜色4:
颜色5:
颜色6:
颜色7:
颜色8:
颜色9:
颜色10:

字体


在线绘制GO弦图

GO chord图(GO弦图)

简介
如何获得该数据,可以使用GO analysis或者metascape提交基因,计算富集,得到结果后进行绘图。参考格式转换页面
输入数据说明
数据包括3部分,第一列是基因,最后一列是logFC(名字不变,仅替换数据即可),即基因的变化倍数,用于排序及基因块颜色(若没有logFC,程序会自动添加,基因色块用灰色)
其余列是GO term,其中1表示该基因在这个GO term中,0表示不在。默认不过滤,即有几个显示几个,20-30个基因,6-8个term效果比较好。
注意:
1. 也可以用于具有类似包含关系的其他数据中,例如KEGG Pathway。
2. 若term名太长,可以用inkscape编辑svg输出图片。
3. 若不是正圆,修改图片长度或者高度参数。
4. 若logfc没显示,可以将GO图例文字大小调小以显示。
生物医学常见应用举例: Gene Ontology/KEGG等富集结果中,基因是否在某条term中(示例数据)。例子:Molecular and Cellular Response to Experimental Anisakis pegreffii (Nematoda, Anisakidae) Third-Stage Larval Infection in Rats Fig 4, 5
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
640+篇google学术,490+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 30 July 2022), a free online platform for data analysis and visualization.

4)交流群/公众号