用前必读
1,使用输入检查工具检查输入数据,默认仅支持英文字符(部分模块除外)
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后再粘贴到输入框
3,使用SVG图片编辑器修改文字、字体,图例位置,处理文字截断等,参考inkscape实操
4,生信分析项目合作
5,更多干货,页面右下扫描,关注”微生信“公众号或加群讨论!

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注意:比较耗资源,请勿大量提交
必需输入  GO/Pathway富集分析视频教程
输入基因列表(第一列gene symbol,第二列logfc,输入不带header行
若没有logfc列,程序将自动添加1(上调)或-1(下调),用于pathway上色
由于是富集分析,太少不出结果,建议至少50个基因
最多提交3000个基因,超过3000个取前3000个


选择物种









注 :由于该模块很耗费计算资源,仅非工作时间(北京时间22:00-8:00)免费!
此图将消耗 5 微币

go,pathway在线分析

简介
本模块整合了clusterProfiler,pathview等R包。源码见各自官网!
数据说明:
输入基因列表第一列是基因symbol,第二列为logfc,上调为正值,下调为负值。若没有logfc列,程序将自动添加1(上调)和-1(下调),用于pathway上色。
参考文献
Guangchuang Yu, Li-Gen Wang, Yanyan Han, Qing-Yu He. clusterProfiler: an R package for comparing biological themes among gene clusters. OMICS: A Journal of Integrative Biology. 2012, 16(5):284-287.
Luo W, Brouwer C. Pathview: an R/Biocondutor package for pathway-based data integration and visualization. Bioinformatics, 2013, 29(14):1830-1831, doi: 10.1093/bioinformatics/btt285

输入 示例数据
输出 示例结果

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
1300+篇google学术,~1000篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 5 Jun 2023), an online platform for data analysis and visualization.

4)交流群/公众号