用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

人工客服   基因名转换   FC,P转换   常用配色 需求及bug提交   pdf转图片
必需输入  GO/Pathway富集分析视频教程
输入2列:symbol,log2fc;或者输入1列:symbol。大小写敏感

选择物种










其他特殊物种KEGG富集分析

注 :由于该模块很耗费资源,仅非工作时间(北京时间22:10-8:00)免费!
此图将消耗 5 微币,提交后约6分钟出结果,请勿重复提交

go,pathway在线分析

简介
本模块整合了clusterProfiler,pathview等R包。源码见各自官网!
数据说明
输入基因列表第一列是基因symbol,第二列为logfc,上调为正值,下调为负值。若没有logfc列,程序将自动添加1(上调)和-1(下调),用于pathway上色。最多支持4000个基因。
参考文献
Guangchuang Yu, Li-Gen Wang, Yanyan Han, Qing-Yu He. clusterProfiler: an R package for comparing biological themes among gene clusters. OMICS: A Journal of Integrative Biology. 2012, 16(5):284-287.
Luo W, Brouwer C. Pathview: an R/Biocondutor package for pathway-based data integration and visualization. Bioinformatics, 2013, 29(14):1830-1831, doi: 10.1093/bioinformatics/btt285
输入 示例数据
输出 示例结果

如何引用?

建议直接写网址。3600+篇google学术,3000+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 June 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.