用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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必需输入
上传clusterprofiler GSEA结果rds文件(文件名用英文)

待绘图基因集(1行1个,来excel第1列,大小写敏感):
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待标注的基因(一行一个,必需在基因集里边,大小写敏感)


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绘制多个基因集时,显示多少列:
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NES,P,Adjusted P文本的位置
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clusterprofiler GSEA加基因名可视化

简介
在传统gsea可视化的基础上,将感兴趣的基因标注在图上。调用GseaVis包
数据说明
1)必须是本站GSEA分析模块输出的rda(R对象)文件。
2)结果excel表格中第一列的基因集名字,大小写敏感
3)excel表格中最后一列的core genes,或者geneset里边的基因,大小写敏感
论文例子
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输出

如何引用?

建议直接写网址。3600+篇google学术,2800+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 June 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.