用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

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注意:默认右侧最多画12个ORF的坐标
NCBI ORFfinder结果在线可视化

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NCBI orffinder结果可视化

简介
NCBI ORFfinder是最常用的开放阅读框(open reading frame)预测软件。新版相对于旧版信息更加丰富,然后旧版软件的可视化更适合放在文章中。
图中左侧为6个阅读框(+1,+2,+3,-1,-2,-3),其中ORF用颜色块表示,最长ORF用另一种颜色块表示。右侧为相关的数据。用图加表的形式展示,简洁易懂
数据说明
输入数据为NCBI ORFfinder的输出结果,第一行是说明,其余行是每个ORF的相关信息。第一列是ORF的编号,第二列是方向;第三列是读码框编号;第4、5列为ORF的位置;最后一列是长度(核苷酸和蛋白质)。
论文例子
In-Silico Design of a Potent siRNA Molecule for Gene Silencing in Zaire Ebolavirus. Fig2
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
3000+篇google学术,2400+篇知网学术引用
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2024), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 20 Feb 2024) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号