用前必读
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2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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必需输入  在线绘制带VIP维度的代谢组学火山图

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点尺寸(控制点的大小范围)
点最小值: ;点最大值:

X、Y范围
Y轴:p值最小值(小于该值的强制转成该值,例如p=0,转成p=1e-100):
X轴(若都留空,则根据数据自动调整;若都设置有值,根据设置的值调整)
X轴最小值:;X轴最大值:

阈值
p/fdr阈值(y轴):
fc阈值(x轴,注意:不是logfc,所以必须>=1):
VIP阈值(0则不考虑VIP):

轴说明
X轴说明(log2为系统自动添加):
Y轴说明(log10为系统自动添加):

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代谢组火山图(带vip)

简介
代谢组结果中常用的火山图,用不同的颜色表示上调,下调和不显著。与常规火山图不同之处在于,添加了一个变量重要性投影(Variable Importance in Projection,VIP)维度。VIP是一种统计度量,用于评估在偏最小二乘判别分析(partial least-squares discrimination analysis,PLS-DA)、正交偏最小二乘判别分析(orthogonal partial least-squares discrimination analysis,OPLS-DA)等多变量分析方法中,每个变量(例如,代谢物)对于模型的解释能力和重要性的贡献。调用ggplot2 R包
数据说明
输入数据为4列,第一列是名字(唯一),第二列是log2FC(有正有负),第三列是p值(或者FDR),第四列是VIP值。
论文例子
Metabolomics combined with network pharmacology reveals a role for astragaloside IV in inhibiting enterovirus 71 replication via PI3K-AKT signaling. Fig 4B
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如何引用?

建议直接写网址。4600+篇google学术,3700+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Oct 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.