用前必读
1,使用输入检查工具检查输入数据,默认仅支持英文字符(部分模块除外)
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后再粘贴到输入框
3,使用SVG图片编辑器修改文字、字体,图例位置,处理文字截断等,参考inkscape实操
4,数据分析项目合作
5,更多干货,页面右下扫描,关注”微生信“公众号或加群讨论!

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必需输入
数据较少(直接拷贝数据并粘贴到输入框):

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文)


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UMAP降维

简介
UMAP (uniform manifold approximate projection)是一种非线性降维算法,广泛用于单细胞等数据降维,能够很好地将高维数据降维到2维,并进行可视化。与t-SNE相比,计算更快,并能保留不同cluster间的关系。
数据说明
数据为矩阵形式,行为样品(例如细胞),列为特征(feature,例如基因)
论文例子
Fig2f
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
1100+篇google学术,860+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2023), an online platform for data analysis and visualization.

4)交流群/公众号