用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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颜色
感兴趣基因点颜色:
上调基因点颜色:
下调基因点颜色:
不显著基因点颜色:
注:若绘制双色火山图,请将上调,下调,不显著三个颜色设置为相同颜色
若绘制四色火山图,请设置四种不同的颜色

颜色代表的类别
感兴趣基因点类别名字:
上调颜色类别名字(或者两颜色时,不感兴趣基因点类别名字):
下调颜色类别名字:
不显著颜色类别名字:
注意:若绘制双色火山图,则仅需设置前两个框
若绘制四色火山图,则四个框都要设置

点尺寸
感兴趣基因点大小:;其他点大小:
点透明度:

X、Y范围
Y轴:p值最小值(小于该值的强制转成该值,例如p=0,转成p=1e-100):
X轴(若都留空,则根据数据自动调整;若都设置有值,根据设置的值调整)
X轴最小值:;X轴最大值:

阈值
p/fdr阈值(y轴):
fc阈值(x轴,注意:不是logfc,所以必须>=1):

轴说明
X轴说明(log2为系统自动添加):
Y轴说明(log10为系统自动添加):

字体


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双色或四色火山图

简介
双色火山图:感兴趣基因点为一种颜色,其他基因点为另一种颜色。
四色火山图:感兴趣基因点为一种颜色,其他基因点:上调一种颜色,下调一种颜色,不显著一种颜色。
数据说明
火山图输入数据为3列,第一列是名字(唯一),第二列是log2FC(有正有负),第三列是p值(或者FDR)。
感兴趣的待标注基因:一行一个基因,必需在火山图数据的第一列里吧,大小写敏感。
论文例子
Proximity labelling of pro-interleukin-1α reveals evolutionary conserved nuclear interactions. Fig2 C
输入 示例数据
输出

如何引用?

建议直接写网址。3900+篇google学术,3200+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 30 Aug 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.