triplex DNA

简介
Triplex DNA 是一种特殊的DNA结构，它由三条核苷酸链组成，形成三股螺旋结构。这种结构的形成是由于第三条链通过胡斯坦碱基配对与双螺旋DNA中的一条链以特殊的氢键相连。在这种结构中，三股链通常都是同型聚嘌呤或聚嘧啶，即它们由相同类型的碱基组成。第三个碱基以腺嘌呤(A)或胸腺嘧啶(T)与A-T碱基对中的腺嘌呤配对；鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)与G-C碱基对中的鸟嘌呤配对。值得注意的是，胞嘧啶在配对时必须质子化(C+)，以提供与G的N7结合的氢键供体，且它与G配对时只形成两个氢键。
Triplex DNA在生物化学与分子生物学领域具有重要的应用潜力。它不仅可以用于基因治疗，还可以作为DNA基纳米结构和材料的开发工具。例如，Triplex DNA可以用于组装传感平台和分子开关，以及在pH值变化下可逆的纳米结构组装和解聚。此外，Triplex DNA结构也被用于设计刺激响应性DNA基水凝胶，这些水凝胶能够经历可逆的pH诱导的水凝胶到溶液的转变。
Triplex DNA的研究不仅有助于我们更深入地理解DNA的结构和功能，而且为开发新的生物技术和治疗方法提供了可能。例如，通过利用Triplex DNA的特性，可以实现对特定DNA序列的靶向，从而抑制DNA的转录和复制，产生位点特异性突变，切割DNA，以及诱导同源重组。这些特性使得Triplex DNA在基因治疗和生物技术领域具有广泛的应用前景。
数据说明
输入为序列形式，搜索是否能够形成triplex
论文例子
Triplex: an R/Bioconductor package for identification and visualization of potential intramolecular triplex patterns in DNA sequences Fig 1

输入	GGAAAGCAATGCCAGGCAGGG
输出

如何引用？

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正式引用：Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节：Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节：We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.