用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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三层从属关系圈图(网络图)

简介
根据元素的层次关系,绘制圆圈网络图。中心为根节点,内圈为根节点延伸出来的节点,外圈为内圈所属的节点。该图可以用来展示三层从属关系类型数据的结果(例如OTU从属关系,基因在GO或者Pathway的从属关系等),美观大方。利用ccgraph(调用ggraph R包)绘制。
数据说明
数据包括3列:第1列是phylum(门),第2列是class(纲);第3列是对应的值(丰度等第二列对应的有意义的值),外圈的点大小按照这一列进行映射,必需为正值)。
论文例子
A Prospective Study of Circulating Tumor DNA to Guide Matched Targeted Therapy in Lung Cancers. Fig 1
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正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 June 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.