用前必读
1,输入数据格式(标题、行、列)必需与示例一致,请仔细看右侧说明和示例,标能缺,不能有中文,特殊符号等
2,推荐使用excel存储并调整数据(wps不行),然后粘贴到输入框
3,修改文字、字体,图例位置,处理文字截断等图片编辑,请参考inkscape实操
4,更多干货,请右下扫码,关注”微生信“公众号或加群讨论!
注意:1,不要用微信打开,用浏览器,推荐edge或chrome!
2,分析、作图失败,请对照示例检查输入数据格式!
3,智能客服  人工客服  基因名转换  svg编辑器  FC,P转换  常用配色  影响因子  输入检查

必需输入
绘图数据(带header,仅支持KEGG pathway):


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KEGG pathway富集结果二级分类汇总图操作步骤

此图将消耗 3 微币

KEGG pathway富集结果二级分类汇总图

简介
根据KEGG pathway官网的分类页面https://www.kegg.jp/kegg/pathway.html,pathway可以分成3个级别,我们最常用的是第3级别,通过将第3级别汇总,在第2级别上进行查看,能够更容易地从整体上发现通路所属。
数据说明
数据为两列,第一列是pathway,第二列是pathway中富集的基因个数。然后根据KEGG Pathway分类页面中的前6种进行二级分类汇总!
注意:不同软件出来的名字不是很统一,这里未分类的需要自己手工改下,然后重新提交绘图。更新于:202210
论文例子
CAV1 alleviated CaOx stones formation via suppressing autophagy-dependent ferroptosis Fig3e
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
800+篇google学术,700+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 31 Oct 2022), an online platform for data analysis and visualization.

4)交流群/公众号