用前必读
1,使用输入检查工具检查输入数据,默认仅支持英文字符(部分模块除外)
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后再粘贴到输入框
3,使用SVG图片编辑器修改文字、字体,图例位置,处理文字截断等,参考inkscape实操
4,生信分析项目合作
5,更多干货,页面右下扫描,关注”微生信“公众号或加群讨论!

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KEGG pathway汇总

pathway富集结果分类图

简介
根据pathway富集结果,按照kegg分类进行汇总,将它们归为6大类。
数据说明
数据为两列,第一列是pathway,第二列是pathway中富集的基因个数(或者具有某意义的数值就行,必需为正)。然后根据KEGG Pathway分类页面中的前6种进行分类汇总!
注意:1,不同软件出来的名字不是很统一,这里未分类的需要自己手工改下,然后重新提交绘图。更新于:202305
2,请根据结果对输入的pathway行自行排序
论文例子
Identification of genomic regions associated with multi-silique trait in Brassica napus Fig 5
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
1500+篇google学术,1000+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Jul 2023), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 10 Jul 2023) for providing data analysis and visualization support.