用前必读
1,使用输入检查工具检查输入数据,默认仅支持英文字符(部分模块除外)
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后再粘贴到输入框
3,使用SVG图片编辑器修改文字、字体,图例位置,处理文字截断等,参考inkscape实操
4,数据分析项目合作
5,更多干货,页面右下扫描,关注”微生信“公众号或加群讨论!

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scale

row聚类方法



距离方法



分类形式分组颜色(例如性别,TNM分期),最多能画7组
设置了7个组,每组7种颜色,按首次出现的名字排序
组a:
组b:
组c:
组d:
组e:
组f:
组g:
组h:

数值形式分组颜色(例如riskscore,TMB),最多能画2组
设置了2个组,每组3种颜色(若第2、3种颜色一样,则自动转成2种颜色)
组1:
组2:

字体


带临床数据的热图 -- 给样品添加TNM分期

此图将消耗 3 微币

多分组临床热图

简介
在常规热图基础上添加多个样品分组的信息。一般样品较多,并且样品根据某分组信息排序,列不聚类,行聚类。
数据说明
输入数据包括2个:
1)表达矩阵:第一行是样品名,其余行是某基因在所有样品中的表达值。
2)与样品分组信息。其中第一列是分类的数据类型。若该行(分组)表示分类信息(例如性别,TNM分期),则写成category;若该行代表数值信息(例如riskscore),则写成number。样品顺序与表达矩阵一致。
样品分组信息比表达矩阵多一列表示category还是的number的信息,具体请参考示例数据
论文例子
Integrated analysis of cervical squamous cell carcinoma cohorts from three continents reveals conserved subtypes of prognostic significance Fig 3.
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
1100+篇google学术,860+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2023), an online platform for data analysis and visualization.

4)交流群/公众号