用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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Mfuzz时间序列基因聚类

简介
Mfuzz能够识别表达谱的潜在时间序列模式,并将具有相似模式的基因或蛋白聚类,从而帮助研究者理解基因或蛋白的动态变化模式及其功能联系。该包基于模糊C均值聚类算法,适合于分析转录组数据,并且能够处理标准化后的数据,包括表达量数据或log2比值数据。
数据说明
数据为标准化后的矩阵形式,例如RNA-seq,microarray等。行为基因,列为样品,其中第一行是样品名/组名,多组建议取组内均值。
论文例子
Mfuzz: A software package for soft clustering of microarray data Fig 1
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正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 June 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.