用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

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富集结果数据(带表头):

基因log2倍数变化数据(带表头,必需包含富集结果的基因):


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GOplot的GOcluster图

简介
该图使用圆形聚类形式展示富集结果,外圈是每个基因所在的GO term堆叠柱状图,中圈为log2FC值,内圈为cluster。注意:1,结果中所有基因均转成大写了;2,最多绘制18个GO term。3,结果中z-score(不是常规的统计z-score,仅给一个term是更可能降低(负值)或升高(正值)的暗示,计算方法:(up基因数-down基因数)/sqrt(基因数),例如positive regulation of cytokine production的Zscore = (5-8)/sqrt(13)=-0.83。参考R包:GOplot
数据说明
输入数据包括2个。第一个是富集结果,包括5列:GO id,GO term描述,分类,genes,adj_pval(此列未用在图中,但需要有);第二个是每个基因及基因的log2fc。两个数据必需保持一致(第二个可以输入全部的基因,程序会根据第一个输入的基因自动挑选)。
论文例子
The establishment of a prognostic scoring model based on the new tumor immune microenvironment classification in acute myeloid leukemia. Fig3 C
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
3000+篇google学术,2400+篇知网学术引用
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2024), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 20 Feb 2024) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号