用前必读
1,输入数据格式(标题、行、列)必需与示例一致,请仔细看右侧说明和示例,标能缺,不能有中文,特殊符号等
2,推荐使用excel调整数据(wps不行),然后拷贝粘贴到输入框
3,修改文字字体,图例位置,处理文字截断等图片编辑,请参考inkscape实操
4,更多干货,请右下扫码,关注”微生信“公众号或加群讨论!
注意:1,不要用微信打开,用浏览器,推荐edge或chrome!
2,没有预览就是作图失败,请检查输入数据格式!
3,智能客服  人工客服  基因名转换  在线svg编辑器  FC,P转换  常用配色  影响因子查询

必需输入
富集结果数据(带表头):

基因log2倍数变化数据(带表头,必需包含富集结果的基因):


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按照什么聚类


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GOplot的GOcluster图

简介
该图使用圆形聚类形式展示富集结果,外圈是每个基因所在的GO term堆叠柱状图,中圈为log2FC值,内圈为cluster。注意:1,结果中所有基因均转成大写了;2,最多绘制18个GO term。参考R包:GOplot
数据说明
输入数据包括2个。第一个是富集结果,包括5列:GO id,GO term描述,分类,genes,adj_pval(此列未用在图中,但需要有);第二个是每个基因及基因的log2fc。两个数据必需保持一致(第二个可以输入全部的基因,程序会根据第一个输入的基因自动挑选)。
论文例子
The establishment of a prognostic scoring model based on the new tumor immune microenvironment classification in acute myeloid leukemia. Fig3 C
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
640+篇google学术,490+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 30 July 2022), a free online platform for data analysis and visualization.

4)交流群/公众号