用前必读
1,使用输入检查工具检查输入数据,默认仅支持英文字符(部分模块除外)
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后再粘贴到输入框
3,使用SVG图片编辑器修改文字、字体,图例位置,处理文字截断等,参考inkscape实操
4,生信分析项目合作
5,更多干货,页面右下扫描,关注”微生信“公众号或加群讨论!

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必需输入
富集结果数据(带表头):

基因log2倍数变化数据(带表头,必需包含富集结果的基因):


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GOplot的GOcluster图

简介
该图使用圆形聚类形式展示富集结果,外圈是每个基因所在的GO term堆叠柱状图,中圈为log2FC值,内圈为cluster。注意:1,结果中所有基因均转成大写了;2,最多绘制18个GO term。参考R包:GOplot
数据说明
输入数据包括2个。第一个是富集结果,包括5列:GO id,GO term描述,分类,genes,adj_pval(此列未用在图中,但需要有);第二个是每个基因及基因的log2fc。两个数据必需保持一致(第二个可以输入全部的基因,程序会根据第一个输入的基因自动挑选)。
论文例子
The establishment of a prognostic scoring model based on the new tumor immune microenvironment classification in acute myeloid leukemia. Fig3 C
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
1500+篇google学术,1000+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Jul 2023), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 10 Jul 2023) for providing data analysis and visualization support.