用前必读
1,使用输入检查工具检查输入数据,默认仅支持英文字符(部分模块除外)
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后再粘贴到输入框
3,使用SVG图片编辑器修改文字、字体,图例位置,处理文字截断等,参考inkscape实操
4,生信分析项目合作
5,更多干货,页面右下扫描,关注”微生信“公众号或加群讨论!

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必需输入  桑基-气泡图绘制视频教程   文字教程
输入数据(图是从下往上画的,即输入数据的第一行是画在最下面的,请自行排序):


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sankey图文字大小:
气泡图X轴标注文字:
气泡图P值标注文字(默认前面已经加了-log10):

气泡图颜色
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p值小颜色:

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桑基气泡图(sankey + dot plot)

简介
该图左侧为sankey图,代表每个pathway中包含的基因,右侧为常规的气泡图,气泡大小表示pathway所属的基因个数,气泡颜色表示p值
数据说明
数据必需为5列,第一列为pathway名字,第二列为gene ratio(必需是数值,不能是4/20这种),第三列为p值(或者fdr等),第四列为基因(必需以/分割),第5列为基因count。内置了100种颜色,所以基因总数或者pathway总数不能超过100个
论文例子
Kir2.1-mediated membrane potential promotes nutrient acquisition and inflammation through regulation of nutrient transporters. fig1i
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
1500+篇google学术,1000+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Jul 2023), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 10 Jul 2023) for providing data analysis and visualization support.