用前必读
1,输入数据格式(标题、行、列)必需与示例一致,请仔细看右侧说明和示例,标题不能缺,不能有中文,特殊符号等
2,推荐使用excel调整数据(wps不行),然后拷贝粘贴到输入框
3,修改文字字体,图例位置,处理文字截断等图片编辑,请参考inkscape实操
4,其他问题,请左侧扫码,关注”微生信“公众号或加群讨论!
注意:1,不要用微信打开,用浏览器,用浏览器,用浏览器,推荐chrome!
2,没有预览就是作图失败,请检查输入数据格式!
3,客服很忙,请先仔细阅读页面上说明,确实有问题再咨询!
必需输入
矩阵数据:


图片及文字大小
图片宽度:
图片高度:
相关系数数值文字大小:

相关系数小数位数
2位 3位

相关系数计算方法
pearson spearman

相关系数颜色
低颜色:
中间颜色:
高颜色:

展示method
circle square ellipse number shade color pie

全局形状
正方形 下三角 上三角

是否显示p
不显示p(仅显示相关系数值)
显示p(不显示相关系数数值)

p值显著性水平:
0.05
0.01
0.001
全部标
0.05,0.01(即*和**)
0.05,0.01,0.001(即:*,**和***)

p值不显著标记类型
pch(p不显著的打叉)
p-value(p不显著的用数值表示)
blank(p不显著的不显示)
label_sig(不显著的不标注*,显著的标注*)

注:并非所有的组合都ok!

相关系数矩阵图

简介
使用矩阵形式展示样品间的相关性。
数据说明:
数据为矩阵形式。保留原始顺序。第一列是基因名字,其余列为样品名字,计算不同样品间的相关系数。
生物医学常见应用举例: 相关系数矩阵:Histone Code and Higher-Order Chromatin Folding: A Hypothesis. Fig1
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
439篇文章引用微生信(Google Scholar)。请引用原生R包,Python包等,或使用如下格式:
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn, a free online platform for data analysis and visualization.

4)其他常见问题