用前必读
1,输入数据格式(标题、行、列)必需与示例一致,请仔细看右侧说明和示例,标能缺,不能有中文,特殊符号等
2,推荐使用excel调整数据(wps不行),然后拷贝粘贴到输入框
3,修改文字字体,图例位置,处理文字截断等图片编辑,请参考inkscape实操
4,更多干货,请左侧扫码,关注”微生信“公众号或加群讨论!
注意:1,不要用微信打开,用浏览器,推荐edge或chrome!
2,没有预览就是作图失败,请检查输入数据格式!
3,24h智能客服  人工客服  基因名转换  FC,P转换  常用配色
必需输入
绘图数据:


可选输入:
图像大小
图片宽:;图片高:

字体、位置、角度
行(基因)字体大小:
列(样品)字体大小:
起始角度:
gap角度:
样品名位置X:
样品名位置Y:

颜色
低颜色:
中间颜色:
高颜色:

聚类方法



距离方法


环形聚类图

简介:
利用颜色表示表达值(原始或标准化),并使用距离矩阵进行聚类。此图调用circlize包(Gu, Z. circlize implements and enhances circular visualization in R)绘图。默认仅对行进行聚类,没有scale。
数据说明:
数据为矩阵形式。第一行为样品名,每列一个样品,其余行为数据行(例如基因表达值)。
生物医学常见应用:
基因表达聚类图。例子:Gu, Z. circlize implements and enhances circular visualization in R Fig 1.
输入
sample	A-1	A-2	A-3	B-1	B-2	B-3
gene1	5.70	11.70	9.90	5.70	4.50	3.20
gene2	9.43	10.67	9.39	3.40	2.50	2.30
gene3	10.59	9.89	8.50	4.20	5.75	2.50
gene4	10.38	10.20	8.50	5.10	2.80	2.40
gene5	5.75	10.85	10.90	3.90	4.20	2.80
gene6	9.82	10.45	8.50	2.50	3.40	3.50
gene7	8.90	11.02	10.33	5.75	2.40	5.75
gene8	10.59	10.67	9.94	6.55	5.75	5.55
gene9	2.50	5.20	3.50	9.21	9.76	11.47
gene10	3.50	4.20	2.50	9.21	11.78	5.75
gene11	4.50	3.20	2.70	9.89	10.72	8.81
gene12	3.50	2.20	1.90	10.85	9.76	9.73
gene13	3.50	4.20	3.50	11.33	9.76	10.49
gene14	5.10	1.20	5.75	11.22	9.76	8.81
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
490+篇google学术,350+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn, a free online platform for data analysis and visualization.

4)其他常见问题