曼哈顿图

简介
曼哈顿图是一种散点图，通常用于显示具有大量数据点，许多非零振幅和更高振幅值分布的数据。该图通常用于全基因组关联研究（GWAS）以显示重要的SNP。图中每个点代表一个SNP，纵轴为每个SNP计算出来的Pvalue取-log10，横轴为SNP所在的染色体。基因位点的Pvalue越小即-log10(Pvalue)越大，其与表型性状或疾病等关联程度越强。而且通常来说受到连锁不平衡的影响，强关联位点周围的SNP也会显示出相对较高的信号强度，并依次向两边递减，所以会出现上图中红色部分的现象。一般，在GWAS的研究中，Pvalue的阈值在10^-6 或者10^-8以下。参考：https://www.jianshu.com/p/1edc44fe922f
数据说明：
第一列是SNP名字，第二列是染色体（不带chr）；第三列是位置；第四列为p值。调用R包：CMplot
生物医学常见应用举例： 参考：Genome wide association studies for yield and its component traits under terminal heat stress in Indian mustard (Brassica juncea L.) Fig3

输入	示例数据
输出

1）如何作图？
1，准备作图数据；2，用excel打开数据，调整为示例格式；3，将调整后的数据粘贴到输入框；4，选择参数；5，提交出图

2）为什么不出图？
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3）如何引用？
1100+篇google学术，860+篇知网学术引用
请使用原生R包，Python包进行引用，或使用如下格式（推荐直接写网址）
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2023), an online platform for data analysis and visualization.

4）交流群/公众号