用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据。使用视频教程
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

人工客服  基因名转换  FC,P转换  常用配色  影响因子 新需求及bug提交  pdf转图片
必需输入  三颜色火山图视频教程
数据较少(直接拷贝数据并粘贴到输入框,带header):

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文)

可选输入
图片大小
图片宽度:
图片高度:

文字说明
X轴说明:
Y轴说明:
up说明:
down说明:
无变化说明:

文字大小
轴刻度文字大小:
轴说明文字大小:
图例legend文字大小:
标注的基因名文字大小:

颜色
上调颜色:
下调颜色:
无变化颜色:
分隔线颜色:
点颜色透明度:

阈值及其他
P最小值(例如小于1e-100的p值被设置为1e-100,最小支持1e-323):
倍数变化阈值(必需>1):
P值或FDR等阈值:
marker点大小:
X轴范围(若都留空,则根据数据自动调整;若都设置数值,则根据所设数值调整)
X轴最小值:;X轴最大值:
Y轴最大值(最小值默认0):

点(marker)形状


网格


待标注基因(一行一个,必需在第一列中,大小写敏感)


基因名到点的距离(名字和点间带不带线,非0则带线)
X方向:;Y方向:
待标注基因名颜色:

字体


火山图(volcano plot)

简介
形如火山喷发,向两侧越来越宽,故名。
数据说明
数据包括3列,第1列是基因名,或者miRNA名,circRNA名字等,必需唯一;第2列是log2fc,上调>=0,下调<0,不能为空,inf,-inf;第3列为p值或fdr值,不能为空,NA等
注意:1,X轴是log2的,一般不超过15,若超过15,请检查输入数据!
论文例子
Identification of Gene Expression Changes Associated With Uterine Receptivity in Mice Fig 1A.
写文章参考
Volcano plot of differentially expressed genes between cancer and normal. Red dots represents upregulated genes, blue dots represents downregulated genes, and gray dots represent genes that were not differentially expressed (P < 0.05, |logFC|>1.0).
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,数据放在excel里边,2,根据示例的行或者列,调整为示例样式;3,将调整后的数据拷贝粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
1,输入检查工具初步检查输入,根据提示修正;2,观看输入框上面的B站视频介绍;3,并仔细阅读右侧说明,示例数据;4,提交人工客服处理
3)如何引用?
建议直接写网址。3400+篇google学术,2700+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 May 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号