不带着丝粒的基因组位点染色体分布图
简介
该图一般用来表示peak,SNP,基因等在染色体上的全局分布。
数据说明
染色体长度数据包括两列:第一列为染色体名字,第二列为染色体长度
基因组位点数据包括3列(第3列可选):第一列是染色体名字(必需与上述染色体长度数据一致);第二列为位点;第三列为类型(例如up,dn等,可选,最多6种可选颜色)。
论文例子
染色体长度输入 |
2A 780798557
3A 750843639
7B 750620385
4A 744588157
7A 736706236
6B 720988478
5B 713149757
5A 709773743
1B 689851870
4B 673617499
2D 651852609
7D 638686055
6A 618079260
3D 615552423
1A 594102056
5D 566080677
4D 509857067
1D 495453186
6D 473592718 |
基因组位点输入 |
chrom pos type
2A 50602155 A
2A 58861277 A
3A 178099541 A
3A 77794217 B
4D 20732565 B
4D 11935999 B |
输出 |
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如何引用?
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正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.
SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.