免疫浸润(Immune infiltration)

原理

肿瘤组织中并不是100%的细胞都是肿瘤细胞,还含有基质细胞,成纤维细胞,免疫细胞等,这些细胞构成了肿瘤微环境。 为了准确评估肿瘤微环境中免疫细胞的构成,我们可以使用cibersort对RNA表达谱数据去卷积,以估计22种不同细胞类型和功能状态的免疫细胞的丰度。

结果展示

1,每个样品的22种免疫细胞占比
2,占比bar图
3,热图
4,两组比较的box图

其他高级分析

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