注意:输入数据格式(行、列)必需与右侧示例一致,制表符分割
1,数据来自excel,直接拷贝待绘图数据,粘贴到输入数据框即可
2,数据来自txt,各列需要制表符(tab键)分割,直接拷贝数据,粘贴到输入数据框
3,修改文字字体,图例位置,处理文字截断等图片编辑,请参考inkscape实操
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相关系数方法
pearson(线性回归)
pearson(loess回归)
spearman(线性回归)
spearman(loess回归)

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Pearson、Spearman相关系数


简介
皮尔逊相关系数(Pearson correlation coefficient),用来反映两个随机变量之间的线性相关程度。r的取值在-1与1之间。取值为1时,表示两个随机变量之间呈完全正相关关系;取值为-1时,表示两个随机变量之间呈完全负相关关系;取值为0时,表示两个随机变量之间线性无关。
斯皮尔曼相关系数(Spearman correlation coefficient),连续数据,正态分布,线性关系,用皮尔逊相关系数是最巧当的,当然用斯皮尔曼相关系数也可以,只是效率没有皮尔逊相关系数高;上述任一条件不满足,就使用斯皮尔曼相关系数,不能使用皮尔逊相关系数。两个定序数据之间使用斯皮尔曼相关系数。
数据说明:
矩阵形式数据,不能有重复的名字。第一列是说明,第二列到最后一列是每个样品对应的值。若数值包括2列,则绘制散点图,多于两列,输出相关系数矩阵,可以将结果粘贴到相关系数作图
生物医学常见应用:
pearson,spearman相关系数计算,作图。
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
140篇文章引用我们(Google Scholoar)。请引用原生R包,Python包等,或使用如下格式:
Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, a free online platform for data analysis and visualization.

4)其他常见问题