相关系数矩阵图
简介
使用矩阵形式展示样品间的相关性程序。
数据说明:
数据为相关系数矩阵,保留原始顺序。
相关系数计算
生物医学常见应用举例:
1, 相关系数矩阵(示例数据)
输入 |
corr mpg cyl disp hp drat wt qsec
mpg 1.00 -0.85 -0.84 -0.77 0.68 -0.86 0.41
cyl -0.85 1.00 0.90 0.83 -0.69 0.78 -0.59
disp -0.84 0.90 1.00 0.79 -0.71 0.88 -0.43
hp -0.77 0.83 0.79 1.00 -0.44 0.65 -0.70
drat 0.68 -0.69 -0.71 -0.44 1.00 -0.71 0.09
wt -0.86 0.78 0.88 0.65 -0.71 1.00 -0.17
qsec 0.41 -0.59 -0.43 -0.70 0.09 -0.17 1.00 |
输出 |
|
常见问题
1,如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2,为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据。常见错误包括:非制表符分割,数据列数不对,没有带title等
3,导出图片?
默认提供3种类型图片供下载:pdf, svg和png(300 dpi),部分未提供的,请在生成图片上点击鼠标右键,选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改)。推荐使用
chrome浏览器
4,编辑图片,以满足杂志需求?
默认Arial字体,8 x 6(或6 x 6)大小(inch)。下载
Inkscape软件(最兼容,推荐,
inkscape常用技巧),打开另存的svg文件,修改布局,文字等后,导出pdf或其他格式图片
5,如何引用
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Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, an online platform for data analysis and visualization.