用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

人工客服  基因名转换  FC,P转换  常用配色  影响因子 新需求及bug提交  pdf转图片

必需输入  带分割的矩阵热图绘制视频
请勿上传超过5000行的矩阵
数据较少(直接拷贝数据并粘贴到输入框):

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文)


可选输入
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热图颜色
低颜色:
中间颜色:
高颜色:
颜色个数(越大越平滑):

cut成几部分(1则不cut)
行聚类树cut:
列聚类树cut:


聚类方法



距离方法



回调函数 注:新版与标注某几个基因模块一致


scale方向(z-score转化)


显示行名


显示列名


是否去除表达值完全一样的行(默认去除)


colorbar颜色范围(不填则默认)
从小到大写,英文逗号分隔,例如-2,-1,0,1,2


字体


此图将消耗 4 微币

带聚类树自动分割(cut)的热图

简介
根据预设值的切割数,将聚类热图根据层次聚类结果用空白线进行分割,调用pheatmap R包
数据说明
第一行为样品名字。第一列是基因名,其余为数据。数据进行双向聚类,并输出每行、每列所在的cluster(可以通过搜索pdf图上的名字,来确定结果cluster数字在图上的位置,然后使用其他热图模块重新绘图)
注意:1,若基因有重名的,取均值;样品也不能有重名的。2,制表符分隔,可以在excel中做转化(例如log2等,这里默认数据已经处理好),然后贴过来。

论文例子
Fig 1.
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
3000+篇google学术,2400+篇知网学术引用
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2024), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 20 Feb 2024) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号