用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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必需输入 请勿上传超过5000行的矩阵
数据较少(直接拷贝数据并粘贴到输入框):

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文)

待标注基因(一行一个)

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列(样品名)字体大小:

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中间颜色:
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颜色个数(越大越平滑):

scale方向(z-score转化)


要显示的名字


聚类方向


聚类方法



距离方法



显示网格线(默认不显示;显示的话,默认灰色)


是否去除表达值完全一样的行(默认去除)


colorbar颜色范围(不填则默认)
从小到大写,英文逗号分隔,例如-2,-1,0,1,2


字体


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带几个基因标注的聚类图,热图

简介
利用颜色表示表达值(原始或标准化),并使用距离矩阵进行聚类,然后将若干感兴趣的基因(而非全部基因)标注在右侧。调用complexheatmap R包
数据说明
第一行为group名字,第二行为样品名字,其余为数据(其中第一列是基因名)
注意:1,默认以均值合并相同基因名的表达量;2,样品名不能有重复。
论文例子
输入 示例数据
输出

如何引用?

建议直接写网址。4800+篇google学术,3900+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.