带几个基因标注的聚类图,热图
简介
利用颜色表示表达值(原始或标准化),并使用距离矩阵进行聚类,然后将若干感兴趣的基因(而非全部基因)标注在右侧。调用complexheatmap R包
数据说明
第一行为group名字,第二行为样品名字,其余为数据(其中第一列是基因名)
注意:1,默认以均值合并相同基因名的表达量;2,样品名不能有重复。
论文例子
如何引用?
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知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.
SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.