注意:输入数据格式(行、列)必需与右侧示例一致,制表符分割
1,数据来自excel,直接拷贝待绘图数据,粘贴到输入数据框即可
2,数据来自txt,各列需要制表符(tab键)分割,直接拷贝数据,粘贴到输入数据框
3,修改文字字体,图例位置,处理文字截断等图片编辑,请参考inkscape实操
4,其他问题,请左侧扫码,关注”微信智能客服“或加群讨论!
注意:比较耗资源,请勿大量提交
必需输入
输入基因列表(第一列是基因symbol,第二列为logfc,
若没有logfc可以用1或-1代替,1表示上调,-1表示下调):
最多提交3000个基因,超过3000个取前3000个


选择物种
human
mouse
rat
zebrafish
pig
chicken

注:由于该模块很耗费计算资源,仅非工作时间(北京时间22:00-8:00)免费!
此图将消耗 20 微币,提交后勿刷新,约5分钟出结果

go,pathway在线分析

简介
本模块整合了clusterProfiler,pathview。源码见各自官网!
数据说明:
输入基因列表第一列是基因symbol,第二列为logfc,上调为正值,下调为负值,若没有可以用1(上调)和-1(下调)代替。
暂时支持所6个物种
参考文献
Guangchuang Yu, Li-Gen Wang, Yanyan Han, Qing-Yu He. clusterProfiler: an R package for comparing biological themes among gene clusters. OMICS: A Journal of Integrative Biology. 2012, 16(5):284-287.
Luo W, Brouwer C. Pathview: an R/Biocondutor package for pathway-based data integration and visualization. Bioinformatics, 2013, 29(14):1830-1831, doi: 10.1093/bioinformatics/btt285

输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
140篇文章引用我们(Google Scholoar)。请引用原生R包,Python包等,或使用如下格式:
Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, a free online platform for data analysis and visualization.

4)其他常见问题