小提琴图(violin plot)
数据说明:数据为N列:第一列是名字,后边几列是某列对应的某行的数据,带表头。默认可以画20个,前12个颜色可选,剩下的使用默认颜色
生物医学常见应用举例:1,表达谱芯片、转录组测序等,用于描述样品间的整体特征,与box plot类似,但包含更多信息
输入 |
genes A1 A2 A3 B1 B2 B3
gene1 11.33 11.33 11.33 13.25 13.25 13.25
gene2 11.5 11.5 11.5 13.5 13.5 13.5
gene3 13.14 13.14 13.14 15.24 15.24 15.24
gene4 13.25 13.25 13.25 16.2 16.2 16.2
gene5 13.5 13.5 13.5 17.5 17.5 17.5
gene6 14 14 14 15.5 15.5 15.5
gene7 15 15 15 18.24 18.24 18.24
gene8 17 17 17 19.2 19.2 19.2
gene9 17.61 17.61 17.61 20.5 20.5 20.5
gene10 18.06 18.06 18.06 20.64 20.64 20.64 |
输出 |
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常见问题
1,如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2,为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据。常见错误包括:非制表符分割,数据列数不对,没有带title等
3,导出图片?
默认提供3种类型图片供下载:pdf, svg和png(300 dpi),部分未提供的,请在生成图片上点击鼠标右键,选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改)。推荐使用
chrome浏览器
4,编辑图片,以满足杂志需求?
默认Arial字体,8 x 6(或6 x 6)大小(inch)。下载
Inkscape软件(最兼容,推荐,
inkscape常用技巧),打开另存的svg文件,修改布局,文字等后,导出pdf或其他格式图片
5,如何引用
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Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, an online platform for data analysis and visualization.