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物种累积曲线

简介
物种累积曲线(Species accumulation curves,SAC),用于估计特定区域中的物种数量。物种累积曲线反映的是抽样个数对物种多样性的影响,当抽样个数较少时,发现的物种并不全面,并不能表征整个群落结构;随着抽样个数的上升,发现的物种种类数越来越多,也更能表征这个群落结构。这里的“抽样”,既可以指物种个体数量,也可以指观测的样方数量。
数据说明:
矩阵形式。每一行代表了一个样本,不同样本采样的地点不同,每一列是1个物种的丰度。最终的物种累计曲线中,横坐标是样本个数,纵坐标是发现的物种个数,随着样本个数的增加,发现的物种个数也不断增加;其实,物种累计曲线反应的就是抽样个数对物种多样性的影响;可以看到,当抽样个数较少时,发现的物种并不全面,并不能表征整个群落结构,随着抽样个数的上升,发现的物种数越来越多,也更能表征这个群落结构;在实际分析中,什么样的情况表明我们的采样量足够了呢,主要看曲线的末端,如果曲线末端部分还呈现 急剧上升的趋势,表明抽样量不足;增加样本量,还能继续发现新的物种;当曲线末端上升趋势趋于平缓时,则表明采样量足够,
生物医学常见应用举例
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
3000+篇google学术,2400+篇知网学术引用
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2024), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 20 Feb 2024) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号