物种累积曲线
简介
物种累积曲线(Species accumulation curves,SAC),用于估计特定区域中的物种数量。物种累积曲线反映的是抽样个数对物种多样性的影响,当抽样个数较少时,发现的物种并不全面,并不能表征整个群落结构;随着抽样个数的上升,发现的物种种类数越来越多,也更能表征这个群落结构。这里的“抽样”,既可以指物种个体数量,也可以指观测的样方数量。
数据说明:
矩阵形式。每一行代表了一个样本,不同样本采样的地点不同,每一列是1个物种的丰度。最终的物种累计曲线中,横坐标是样本个数,纵坐标是发现的物种个数,随着样本个数的增加,发现的物种个数也不断增加;其实,物种累计曲线反应的就是抽样个数对物种多样性的影响;可以看到,当抽样个数较少时,发现的物种并不全面,并不能表征整个群落结构,随着抽样个数的上升,发现的物种数越来越多,也更能表征这个群落结构;在实际分析中,什么样的情况表明我们的采样量足够了呢,主要看曲线的末端,如果曲线末端部分还呈现 急剧上升的趋势,表明抽样量不足;增加样本量,还能继续发现新的物种;当曲线末端上升趋势趋于平缓时,则表明采样量足够,
生物医学常见应用举例
1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据
3)如何引用?
570+篇google学术,430+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 30 July 2022), a free online platform for data analysis and visualization.
4)交流群/公众号