用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
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4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

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必需输入
联合结果(3列:基因名,Y轴log2FC,X轴log2FC)

待标注基因(一行一个,来自数据的第一列)


可选输入
图片大小
图片宽度:;图片高度:

各部分颜色及点大小
左上: ;中上: ;右上:
左中: ;中中: ;右中:
左下: ;中下: ;右下:
点大小:

显著阈值(倍数变化是FC,不是log2FC)
倍数变化1(第2列):;倍数变化2(第3列):

X、Y轴范围(不填则默认)
X轴最小值:;X轴最大值:
Y轴最小值:;Y轴最大值:

X轴说明:
Y轴说明:

字体大小
轴说明字体大小:;轴刻度字体大小:
标注基因字体大小:;各象限显著基因个数字体大小:

标注基因位移(值越大,则点-基因的连线越长)
X轴位移距离:;Y轴位移距离:

字体


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组学联合分析九象限图

简介
两种组学,例如相同的样品既做了mRNA-seq,又做了merip-seq,可以进行关联分析,绘制9象限图,以方便筛选基因,同时可以标注感兴趣的基因点。注意:这里不考虑p值,若想考虑p值,若要考虑p值,请绘制四象限图
数据说明
必需输入包括3列:第1列是基因名(或者其他唯一id);第2列是组学1(例如m6A)的倍数变化;第3列是组学2的倍数变化,根据log2fc将数据分成9个象限
可选输入是待标注的基因名,一行一个,来自数据的第一列
论文例子
Comprehensive Analysis of the Transcriptome-Wide m6A Methylome in Endometrioid Ovarian Cancer. fig2B
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
3200+篇google学术,2600+篇知网学术
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2024), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 20 Feb 2024) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号