注意:输入数据格式(行、列)必需与右侧示例一致,制表符分割
1,数据来自excel,直接拷贝待绘图数据,粘贴到输入数据框即可
2,数据来自txt,各列需要制表符(tab键)分割,直接拷贝数据,粘贴到输入数据框即可
必需输入
染色体长度数据:

基因组位点数据:


可选输入:
图边距(图长宽比例不协调,或者文字被截断情况下使用
右必需大于左;上必需大于下):
左:,右:
下:,上:
颜色
颜色1:
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在线绘制不带着丝粒的简单基因组位点染色体分布图


简介
该图一般用来表示peak,SNP,基因等在染色体上的全局分布。以圆滑的弧形表示染色体长臂/短臂的两端
数据说明
染色体长度数据包括3列:第一列为染色体名字,第二列为染色体长度,第三列为着丝粒位置(单坐标代替)
基因组位点数据包括3列(第3列可选):第一列是染色体名字(必需与上述染色体长度数据一致);第二列为位点;第三列为类型(例如up,dn等,可选,最多6种可选颜色)。
生物医学常见应用
例子:

染色体长度输入
2A	780798557	326000000
3A	750843639	316000000
7B	750620385	288000000
4A	744588157	264000000
7A	736706236	360000000
6B	720988478	323000000
5B	713149757	198000000
5A	709773743	108000000
1B	689851870	237000000
4B	673617499	303000000
2D	651852609	264000000
7D	638686055	336000000
6A	618079260	283000000
3D	615552423	237000000
1A	594102056	210000000
5D	566080677	185000000
4D	509857067	182000000
1D	495453186	166000000
6D	473592718	211000000
基因组位点输入
chrom	pos	type
2A	50602155	A
2A	58861277	A
3A	178099541	A
3A	77794217	B
4D	20732565	B
4D	11935999	B
输出

常见问题
  • 1,如何作图?
  • 1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
  • 2,为什么不出图?
  • 程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据。常见错误包括:非制表符分割,数据列数不对,没有带title等
  • 3,导出图片?
  • 默认提供3种类型图片供下载:pdf, svg和png(300 dpi),部分未提供的,请在生成图片上点击鼠标右键,选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改)。推荐使用chrome浏览器
  • 4,编辑图片,以满足杂志需求?
  • 默认Arial字体,8 x 6(或6 x 6)大小(inch)。下载Inkscape软件(最兼容,推荐,inkscape常用技巧),打开另存的svg文件,修改布局,文字等后,导出pdf或其他格式图片
  • 5,如何引用
  • 本站内容未公开发表paper,如需引用,请使用如下格式,或者原生R包:
    Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, an online platform for data analysis and visualization.