在线绘制不带着丝粒的简单基因组位点染色体分布图
简介
该图一般用来表示peak，SNP，基因等在染色体上的全局分布。以圆滑的弧形表示染色体长臂/短臂的两端
数据说明
染色体长度数据包括3列：第一列为染色体名字，第二列为染色体长度，第三列为着丝粒位置（单坐标代替）
基因组位点数据包括3列（第3列可选）：第一列是染色体名字（必需与上述染色体长度数据一致）；第二列为位点；第三列为类型（例如up，dn等，可选，最多6种可选颜色）。
论文例子
| 染色体长度输入 |
2A 780798557 326000000
3A 750843639 316000000
7B 750620385 288000000
4A 744588157 264000000
7A 736706236 360000000
6B 720988478 323000000
5B 713149757 198000000
5A 709773743 108000000
1B 689851870 237000000
4B 673617499 303000000
2D 651852609 264000000
7D 638686055 336000000
6A 618079260 283000000
3D 615552423 237000000
1A 594102056 210000000
5D 566080677 185000000
4D 509857067 182000000
1D 495453186 166000000
6D 473592718 211000000
|
| 基因组位点输入 |
chrom pos type
2A 50602155 A
2A 58861277 A
3A 178099541 A
3A 77794217 B
4D 20732565 B
4D 11935999 B |
| 输出 |
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如何引用？
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正式引用：Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.
SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节：Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节：We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.
