左右双向条形图
简介
该图一般用来表示具有二元形式数据。例如上调,下调的kegg富集通路
数据说明
数据包括右侧的和左侧的两个。均包含两列,第一列是名字,第二列是数值。其中右侧的为正,左侧的系统自动取负。
生物医学常见应用
例子:
右侧输入 |
pathway pvalue
HIF-1 signaling pathway 4.71868E-07
PI3K-Akt signaling pathway 0.0003725
Glycolysis / Gluconeogenesis 0.000849109
Insulin resistance 0.002150607
FoxO signaling pathway 0.01347178
Insulin signaling pathway 0.03787553
ErbB signaling pathway 0.04519473
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左侧输入 |
pathway pvalue
Protein digestion and absorption 1.15919E-08
Calcium signaling pathway 3.79658E-06
Insulin secretion 0.01048817
Endocrine and other factor 0.01163136
Dopaminergic synapse 0.04350386
Linoleic acid metabolism 0.03474885
Fatty acid biosynthesis 0.0467958 |
输出 |
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常见问题
1,如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2,为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据。常见错误包括:非制表符分割,数据列数不对,没有带title等
3,导出图片?
默认提供3种类型图片供下载:pdf, svg和png(300 dpi),部分未提供的,请在生成图片上点击鼠标右键,选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改)。推荐使用
chrome浏览器
4,编辑图片,以满足杂志需求?
默认Arial字体,8 x 6(或6 x 6)大小(inch)。下载
Inkscape软件(最兼容,推荐,
inkscape常用技巧),打开另存的svg文件,修改布局,文字等后,导出pdf或其他格式图片
5,如何引用
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Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, an online platform for data analysis and visualization.