简单水平柱状图、条形图(horizontal bar plot)
数据说明:数据为3列,第一列是Y轴说明名字,第二列是bar长度数值,第三列为颜色编码,分别对应1-6,即这里的数值只能写1-6,对应六种可选颜色。
生物医学常见应用举例:
1,KEGG富集通路条形图(
左下例图数据)
2,基因本体论(Gene Ontology)Biological Processes,Cellular Components和Molecular Function三种不同颜色绘制在一张图上。
右下示例数据
输入 |
item value color
Mon 820 1
Tue 932 1
Wed 901 1
Thu 934 1
Fri 1290 1
Sat 1330 1
Sun 1320 1 |
输出 |
|
常见问题
1,如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2,为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据。常见错误包括:非制表符分割,数据列数不对,没有带title等
3,导出图片?
默认提供3种类型图片供下载:pdf, svg和png(300 dpi),部分未提供的,请在生成图片上点击鼠标右键,选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改)。推荐使用
chrome浏览器
4,编辑图片,以满足杂志需求?
默认Arial字体,8 x 6(或6 x 6)大小(inch)。下载
Inkscape软件(最兼容,推荐,
inkscape常用技巧),打开另存的svg文件,修改布局,文字等后,导出pdf或其他格式图片
5,如何引用
本站内容未公开发表paper,如需引用,请使用如下格式,或者原生R包:
Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, an online platform for data analysis and visualization.