hclust聚类树
简介
hclust(层次聚类)是一种通过树状图(dendrogram)展示数据嵌套关系的聚类方法。它采用自下而上的聚合策略:起初每个样本自成一类,然后依据距离度量,迭代合并最近的两类,直至所有样本聚为一类。用户可通过剪枝(在指定高度截断)灵活获得不同数量的类别。其核心优势在于无需预设类别数,且能直观呈现样本间的亲疏层次,广泛用于探索性数据分析与生物信息学等领域。
输入数据
数据为矩阵形式,行数基因,列是样品。调用hclust 函数
论文例子
如何引用?
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(知网)论文
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.
SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on May 4, 2026), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.