用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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第2圈:term基因数/pvalue
第2圈低颜色:
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第2圈标注(默认为-log10(输入)):

第3圈:up或/和down的基因数

仅包含up或者down的基因数
第3圈颜色1:
第3圈字体大小1:
第3圈标注1:

既包含up的基因数,又包含down的基因数,后台会根据输入的列数自动判断是否额外添加一个圈
第3圈颜色2:
第3圈字体大小2:
第3圈标注2:

最内圈:rich factor bar
最内圈最大值(控制bar高度):

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GO、pathway富集结果圆圈图

简介
使用圆形展示富集结果。从外到内依次为:分类(颜色一样的为同一分类),term总基因数(该term里边包含的基因数,颜色表示该term的富集p/q/fdr值),term中up或down的基因数,rich factor(第3通道基因数/第2通道基因数)。
数据说明
1)仅包含up或者down基因数的结果:第一列为GO或者KEGG条目名;第二列为分类,可以绘制1-4类;第三列为总基因数(一般为输入数据中所有term里边基因的并集数取整);第4列为该term中包含的基因数;第5列为该term富集的p值(或者q值,FDR值等),第6列为做富集分析时输入基因与该条目重叠的基因数;第7列为第6列vs第4列的比值。
2)既包含up基因数,又包括down基因数的结果:第一列为GO或者KEGG条目名;第二列为分类,可以绘制1-4类;第三列为总基因数(一般为输入数据中所有term里边基因的并集数取整);第4列为该term中包含的基因数;第5列为该term富集的p值(或者q值,FDR值等),第6列为做富集分析时输入基因与该条目重叠的基因数(up);第7列为做富集分析时输入基因与该条目重叠的基因数(down);第8列为第6+7列vs第4列的比值。
论文例子
Comparative analysis of drought-responsive physiological and transcriptome in broomcorn millet (Panicum miliaceum L.) genotypes with contrasting drought tolerance. Fig6
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如何引用?

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正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.