用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
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4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
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必需输入  circRNA吸附miRNA图视频教程   文字教程
输入circRNA数据(circRNA名字,1,circRNA长度):

输入miRNA结合数据(miRNA名字,开始,结束,长度约22nt)
多处时不重叠,例如可以是34-50,52-72。不能是34-52,50-70

可选输入
miRNA字体大小
circRNA字体大小
miRNA文字距离中心距离r:

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circRNA颜色:
miRNA颜色:

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circRNA-miRNA结合圆形图

简介
circRNA可以通过吸附miRNA,调节miRNA靶基因的表达,即所谓的ceRNA机制。本图形象地展示了miRNA在circRNA上的结合位点。
数据说明
环状数据部分为3列:circRNA名字,起始坐标(默认1),终止坐标(即长度,这里改成自己的circRNA长度)。结合位置可以使用miRanda预测
miRNA数据部分3列:miRNA名字,结合起始坐标,结合终止坐标。默认按照坐标排序,且坐标无重叠,即miRNA坐标区段不连续
论文例子
Bioinformatics analysis of potential glioblastoma circular RNA sponge network
论文写作
Binding simulation between circRNA and miRNAs. circRNA was represented by outer green circle, and miRNAs were represented by inner red rectangle. The relative locations of miRNAs to circRNA represented the binding sites.
输入 示例数据
输出

如何引用?

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正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.