注意:输入数据格式(行、列)必需与右侧示例一致,制表符分割
1,数据来自excel,直接拷贝待绘图数据,粘贴到输入数据框即可
2,数据来自txt,各列需要制表符(tab键)分割,直接拷贝数据,粘贴到输入数据框即可

必需输入:
输入circRNA数据(circRNA data):

请输入miRNA结合数据(miRNA data):


可选输入:
miRNA字体大小
circRNA字体大小
miRNA文字距离中心距离r:
颜色
circRNA颜色:
miRNA颜色:

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circRNA-miRNA结合圆形图


数据说明circRNA吸附miRNA,根据miRNA结合位点绘图
环状数据部分为3列:circRNA名字,起始坐标(默认1),终止坐标(即长度,这里改成自己的circRNA长度)
miRNA数据部分3列:miRNA名字,结合起始坐标,结合终止坐标。默认按照坐标排序,且坐标无重叠,即miRNA坐标不连续
生物医学常见应用举例: circRNA-miRNA吸附图。例子:CircNT5E Acts as a Sponge of miR-422a to Promote Glioblastoma Tumorigenesis Fig 6a.
circRNA输入
circRNA	1	1000
miRNA输入
miR111111	20	40
miR222222	80	100
miR333333	620	638
miR444444	750	770
miR555555	820	840
miR666666	930	950
miR777777	980	998
输出

常见问题
  • 1,如何作图?
  • 1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
  • 2,为什么不出图?
  • 程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据。常见错误包括:非制表符分割,数据列数不对,没有带title等
  • 3,导出图片?
  • 默认提供3种类型图片供下载:pdf, svg和png(300 dpi),部分未提供的,请在生成图片上点击鼠标右键,选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改)。推荐使用chrome浏览器
  • 4,编辑图片,以满足杂志需求?
  • 默认Arial字体,8 x 6(或6 x 6)大小(inch)。下载Inkscape软件(最兼容,推荐,inkscape常用技巧),打开另存的svg文件,修改布局,文字等后,导出pdf或其他格式图片
  • 5,如何引用
  • 本站内容未公开发表paper,如需引用,请使用如下格式,或者原生R包:
    Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, an online platform for data analysis and visualization.