注意:输入数据格式(行、列)必需与右侧示例一致,制表符分割
1,数据来自excel,直接拷贝待绘图数据,粘贴到输入数据框即可
2,数据来自txt,各列需要制表符(tab键)分割,直接拷贝数据,粘贴到输入数据框即可
必需输入
绘图数据:


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bar宽度:
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P值排序
小->大
大->小
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GO,KEGG富集点线图

简介
该图为GO,KEGG富集结果条形图加点构成。其中条形表示p值大小,条越长,表示p值越小;点表示基因数,点越大,表示基因数越多。该图可以绘制:1,仅GO结果,即BP,CC,MF三种;2,BP,KEGG;3,BP,CC,MF,KEGG
数据说明:
第一列是Term名;第二列是Catogory分类;第三列是Count;第四列为Pvalue;第五列是Regulation。注意:第一行必需跟例子一样,最后一列必需是Up或者Down。
生物医学常见应用举例: 参考:Hepatic transcriptome perturbations in dairy cows fed different forage resources. Fig3
输入 示例数据
输出

常见问题
  • 1,如何作图?
  • 1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
  • 2,为什么不出图?
  • 程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据。常见错误包括:非制表符分割,数据列数不对,没有带title等
  • 3,导出图片?
  • 默认提供3种类型图片供下载:pdf, svg和png(300 dpi),部分未提供的,请在生成图片上点击鼠标右键,选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改)。推荐使用chrome浏览器
  • 4,编辑图片,以满足杂志需求?
  • 默认Arial字体,8 x 6(或6 x 6)大小(inch)。下载Inkscape软件(最兼容,推荐,inkscape常用技巧),打开另存的svg文件,修改布局,文字等后,导出pdf或其他格式图片
  • 5,如何引用
  • 本站内容未公开发表paper,如需引用,请使用如下格式,或者原生R包:
    Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, an online platform for data analysis and visualization.