用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

人工客服  基因名转换  FC,P转换  常用配色  影响因子 新需求及bug提交  pdf转图片

必需输入  三颜色火山图视频教程
使用重复检查工具,检查基因名无重复,且没有inf,NA,空等后使用
数据较少(直接拷贝数据并粘贴到输入框,带header):

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文)


可选输入
图片大小
图片宽度:
图片高度:

文字说明
X轴说明:
Y轴说明:
up说明:
down说明:
无变化说明:

文字大小
轴刻度文字大小:
轴说明文字大小:
图例legend文字大小:
标注的基因名文字大小:

颜色
上调颜色:
下调颜色:
无变化颜色:
分隔线颜色:
点颜色透明度:

阈值及其他
P最小值(例如小于1e-100的p值被设置为1e-100,最小支持1e-323):
倍数变化阈值(必需>1):
P值或FDR等阈值:
marker点大小:
X轴最大值(最小值默认负的最大值):
Y轴最大值(最小值默认0):

点(marker)形状


网格


待标注基因(一行一个,必需在第一列中,大小写敏感)


基因名到点的距离(名字和点间带不带线,非0则带线)
X方向:;Y方向:
待标注基因名颜色:

字体



火山图(volcano plot)

简介
形如火山喷发,向两侧越来越宽,故名。
数据说明
数据包括3列,第1列是基因名,或者miRNA名,circRNA名字等,必需唯一;第2列是log2fc,上调>=0,下调<0,不能为空,inf,-inf;第3列为p值或fdr值,不能为空,NA等
注意:1,X轴是log2的,一般不超过15,若超过15,请检查输入数据!
论文例子
Identification of Gene Expression Changes Associated With Uterine Receptivity in Mice Fig 1A.
写文章参考
Volcano plot of differentially expressed genes between cancer and normal. Red dots represents upregulated genes, blue dots represents downregulated genes, and gray dots represent genes that were not differentially expressed (P < 0.05, |logFC|>1.0).
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
2900+篇google学术,2400+篇知网学术引用
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2024), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 20 Feb 2024) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号