用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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必需输入
数据较少,直接粘贴

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文,不能超过10M)

可选输入
promoter范围(TSS上游及下游)
upstream:
downstream:

基因组build(注意:这里用Ensembl gtf进行注释)





饼图字体


计算量较大,约30s出结果
此分析将消耗 3 微币

对染色体区域进行基因注释

简介
使用chipseeker R包对来自chip-seq, ATAC-seq,cut & tag等的富集峰(peak)区域进行基因注释,链接位置和基因信息(一般不考虑链方向)
输入数据
输入为bed格式:前3列为chrom,start,end,后边几列可选(注意:首行必需表明每一列数据是什么,即带表头。表头将用在最终的excel中,不要用特殊符号)
论文例子
示例 示例数据
输出
输出分成2部分:第一部分是输入的内容,第二部分是注释内容,包括:peak所在的基因组特征分类(例如3'UTR,5'UTR,promoter,intergenic等),基因名,描述等信息

如何引用?

建议直接写网址。4800+篇google学术,3900+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.